MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba chromosome

Total Repeats: 28924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008229	A	6	6	23	28	100 %	0 %	0 %	0 %	109946641
2	NC_008229	CAA	2	6	49	54	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946641
3	NC_008229	T	7	7	130	136	0 %	100 %	0 %	0 %	109946641
4	NC_008229	GCA	2	6	158	163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109946641
5	NC_008229	GCAT	2	8	221	228	25 %	25 %	25 %	25 %	109946641
6	NC_008229	A	7	7	391	397	100 %	0 %	0 %	0 %	109946641
7	NC_008229	T	6	6	434	439	0 %	100 %	0 %	0 %	109946641
8	NC_008229	GGC	2	6	442	447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109946641
9	NC_008229	A	6	6	508	513	100 %	0 %	0 %	0 %	109946641
10	NC_008229	T	6	6	537	542	0 %	100 %	0 %	0 %	109946641
11	NC_008229	AAC	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946641
12	NC_008229	AGG	2	6	662	667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109946641
13	NC_008229	CAGA	2	8	725	732	50 %	0 %	25 %	25 %	109946641
14	NC_008229	AGA	2	6	756	761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946641
15	NC_008229	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946641
16	NC_008229	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946641
17	NC_008229	A	7	7	1121	1127	100 %	0 %	0 %	0 %	109946641
18	NC_008229	TCGC	2	8	1192	1199	0 %	25 %	25 %	50 %	109946641
19	NC_008229	A	7	7	1255	1261	100 %	0 %	0 %	0 %	109946641
20	NC_008229	GAA	2	6	1267	1272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946641
21	NC_008229	A	7	7	1271	1277	100 %	0 %	0 %	0 %	109946641
22	NC_008229	AGA	2	6	1299	1304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946641
23	NC_008229	TGAA	2	8	1319	1326	50 %	25 %	25 %	0 %	109946641
24	NC_008229	A	6	6	1336	1341	100 %	0 %	0 %	0 %	109946641
25	NC_008229	A	7	7	1578	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	109946642
26	NC_008229	T	7	7	1603	1609	0 %	100 %	0 %	0 %	109946642
27	NC_008229	AGA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946642
28	NC_008229	CAC	2	6	1738	1743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109946642
29	NC_008229	CTT	2	6	1813	1818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946642
30	NC_008229	TAT	2	6	1847	1852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946642
31	NC_008229	TTC	2	6	1877	1882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946642
32	NC_008229	CCAA	2	8	1906	1913	50 %	0 %	0 %	50 %	109946642
33	NC_008229	CTT	2	6	1918	1923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946642
34	NC_008229	AAAC	2	8	1949	1956	75 %	0 %	0 %	25 %	109946642
35	NC_008229	CAA	2	6	1968	1973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946642
36	NC_008229	AGG	2	6	2120	2125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109946642
37	NC_008229	A	6	6	2152	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	109946642
38	NC_008229	CT	3	6	2160	2165	0 %	50 %	0 %	50 %	109946642
39	NC_008229	AAC	2	6	2208	2213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946642
40	NC_008229	AAT	2	6	2217	2222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946642
41	NC_008229	AAT	3	9	2229	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946642
42	NC_008229	TGCG	2	8	2288	2295	0 %	25 %	50 %	25 %	109946642
43	NC_008229	ATG	3	9	2308	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946642
44	NC_008229	ACAA	2	8	2365	2372	75 %	0 %	0 %	25 %	109946642
45	NC_008229	ACC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109946642
46	NC_008229	ATC	2	6	2430	2435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946642
47	NC_008229	AGA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946642
48	NC_008229	TTC	2	6	2518	2523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946642
49	NC_008229	CAC	2	6	2534	2539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109946642
50	NC_008229	AGA	2	6	2600	2605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946642
51	NC_008229	GAT	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946642
52	NC_008229	TTC	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946642
53	NC_008229	CA	3	6	2756	2761	50 %	0 %	0 %	50 %	109946642
54	NC_008229	A	6	6	2781	2786	100 %	0 %	0 %	0 %	109946642
55	NC_008229	ATT	2	6	2818	2823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946642
56	NC_008229	AAAG	2	8	2838	2845	75 %	0 %	25 %	0 %	109946642
57	NC_008229	AAG	2	6	2887	2892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946642
58	NC_008229	AGA	2	6	2915	2920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946642
59	NC_008229	GTT	2	6	2967	2972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109946642
60	NC_008229	TG	3	6	2973	2978	0 %	50 %	50 %	0 %	109946642
61	NC_008229	A	6	6	2979	2984	100 %	0 %	0 %	0 %	109946642
62	NC_008229	TATT	2	8	2991	2998	25 %	75 %	0 %	0 %	109946642
63	NC_008229	T	6	6	3224	3229	0 %	100 %	0 %	0 %	109946643
64	NC_008229	T	6	6	3250	3255	0 %	100 %	0 %	0 %	109946643
65	NC_008229	CAA	2	6	3276	3281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946643
66	NC_008229	A	6	6	3336	3341	100 %	0 %	0 %	0 %	109946643
67	NC_008229	GGT	2	6	3353	3358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109946643
68	NC_008229	A	6	6	3369	3374	100 %	0 %	0 %	0 %	109946643
69	NC_008229	AAG	2	6	3421	3426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946643
70	NC_008229	CAT	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946643
71	NC_008229	TTTA	2	8	3457	3464	25 %	75 %	0 %	0 %	109946643
72	NC_008229	CAA	2	6	3489	3494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946643
73	NC_008229	AGA	2	6	3540	3545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946643
74	NC_008229	A	6	6	3567	3572	100 %	0 %	0 %	0 %	109946643
75	NC_008229	TG	3	6	3581	3586	0 %	50 %	50 %	0 %	109946643
76	NC_008229	A	6	6	3644	3649	100 %	0 %	0 %	0 %	109946643
77	NC_008229	AG	4	8	3668	3675	50 %	0 %	50 %	0 %	109946643
78	NC_008229	TGG	2	6	3756	3761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109946643
79	NC_008229	CAA	2	6	3771	3776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946643
80	NC_008229	GA	3	6	3779	3784	50 %	0 %	50 %	0 %	109946643
81	NC_008229	ATT	2	6	3808	3813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946643
82	NC_008229	T	6	6	3812	3817	0 %	100 %	0 %	0 %	109946643
83	NC_008229	CCA	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109946644
84	NC_008229	ATC	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946644
85	NC_008229	GAT	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946644
86	NC_008229	A	6	6	4177	4182	100 %	0 %	0 %	0 %	109946644
87	NC_008229	A	6	6	4186	4191	100 %	0 %	0 %	0 %	109946644
88	NC_008229	C	6	6	4230	4235	0 %	0 %	0 %	100 %	109946644
89	NC_008229	A	7	7	4304	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	109946644
90	NC_008229	TAA	2	6	4311	4316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946644
91	NC_008229	ATC	2	6	4413	4418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946644
92	NC_008229	G	7	7	4472	4478	0 %	0 %	100 %	0 %	109946644
93	NC_008229	A	6	6	4482	4487	100 %	0 %	0 %	0 %	109946644
94	NC_008229	G	6	6	4504	4509	0 %	0 %	100 %	0 %	109946644
95	NC_008229	T	7	7	4513	4519	0 %	100 %	0 %	0 %	109946644
96	NC_008229	TAA	2	6	4551	4556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946645
97	NC_008229	GGT	2	6	4588	4593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109946645
98	NC_008229	T	6	6	4624	4629	0 %	100 %	0 %	0 %	109946645
99	NC_008229	TTC	2	6	4643	4648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946645
100	NC_008229	TCA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946645
101	NC_008229	ATC	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946645
102	NC_008229	CTT	2	6	4693	4698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946645
103	NC_008229	T	6	6	4705	4710	0 %	100 %	0 %	0 %	109946645
104	NC_008229	CAT	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946645
105	NC_008229	CTT	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946645
106	NC_008229	T	6	6	4732	4737	0 %	100 %	0 %	0 %	109946645
107	NC_008229	T	6	6	4823	4828	0 %	100 %	0 %	0 %	109946645
108	NC_008229	AAAT	2	8	5028	5035	75 %	25 %	0 %	0 %	109946646
109	NC_008229	TTA	2	6	5039	5044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946646
110	NC_008229	CTTG	2	8	5077	5084	0 %	50 %	25 %	25 %	109946646
111	NC_008229	GCG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109946646
112	NC_008229	A	8	8	5174	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	109946646
113	NC_008229	TAT	2	6	5344	5349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946646
114	NC_008229	GGC	2	6	5378	5383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109946646
115	NC_008229	A	6	6	5399	5404	100 %	0 %	0 %	0 %	109946646
116	NC_008229	A	7	7	5417	5423	100 %	0 %	0 %	0 %	109946646
117	NC_008229	A	6	6	5464	5469	100 %	0 %	0 %	0 %	109946646
118	NC_008229	TTA	2	6	5501	5506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946646
119	NC_008229	AT	3	6	5590	5595	50 %	50 %	0 %	0 %	109946646
120	NC_008229	T	6	6	5604	5609	0 %	100 %	0 %	0 %	109946646
121	NC_008229	A	6	6	5630	5635	100 %	0 %	0 %	0 %	109946646
122	NC_008229	AAT	2	6	5666	5671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946646
123	NC_008229	AGCG	2	8	5672	5679	25 %	0 %	50 %	25 %	109946646
124	NC_008229	CTT	2	6	5697	5702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946646
125	NC_008229	CAA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946646
126	NC_008229	TAA	2	6	5854	5859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946646
127	NC_008229	ATT	2	6	5947	5952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946646
128	NC_008229	A	8	8	5969	5976	100 %	0 %	0 %	0 %	109946646
129	NC_008229	ATTT	2	8	5979	5986	25 %	75 %	0 %	0 %	109946646
130	NC_008229	A	6	6	5988	5993	100 %	0 %	0 %	0 %	109946646
131	NC_008229	TGT	2	6	6001	6006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109946646
132	NC_008229	GTT	2	6	6022	6027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109946646
133	NC_008229	TGA	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946646
134	NC_008229	GCA	2	6	6076	6081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109946646
135	NC_008229	A	6	6	6114	6119	100 %	0 %	0 %	0 %	109946646
136	NC_008229	CTCTAG	2	12	6183	6194	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	109946646
137	NC_008229	CCCTA	2	10	6236	6245	20 %	20 %	0 %	60 %	109946646
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139	NC_008229	A	6	6	6366	6371	100 %	0 %	0 %	0 %	109946646
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